MySQL作为流行的开源数据库系统其历史最早可以到大约40年前。
Michael“Monty” Widenius在1979年为TcX公司设计了一个叫做Unireg的报表工具，这就是MySQL最初的雏形。
Monty为满足客户的一个项目需求，毅然重新设计整个系统，1995年5月23日MySQL的第一个内部版本发行了，1996年对外公布了官方正式发行版(3.11.1)。
在接下来的两年中，MySQL加入了不少新的特性，并被移植到不同的平台，到1998年，MySQL能够运行在Solaris、FreeBSD、Linux、Windows 95和Windows NT等10多种操作系统之上。1999的冬天，发布了包含事务型存储引擎BDB的MySQL 3.23。
在2000年的时候MySQL将许可改换成了GPL许可模式，也就是说商业用户也无需再购买许可证，这为MySQL的迅速流行打下了基础。同年，芬兰公司Heikki开始接触MySQL AB，尝试将Heikki的存储引擎InnoDB整合到MySQL数据库中，2001年推出正式结合版本MySQL 4.0 Alpha版本。2004年10月，发布了经典的4.1版本，第一次使得MySQL支持子查询，支持Unicode和预编译SQL等功能。
2005年10月，发布了里程碑的MySQL 5.0版本. 在5.0中加入了游标，存储过程，触发器，视图、查询优化以及分布式事务等，实现了"正常数据库管理系统"应当拥有的一整套功能。至此，MySQL明确地表现出向高性能数据库发展的步伐。
2008年初， Sun Microsystems用10亿美元收购了MySQL。
2009年04月Oracle以74亿美元收购Sun 公司，MySQL 转入Oracle 门下。
2010年12月，MySQL 5.5发布，其主要新特性包括半同步的复制及对SIGNAL/RESIGNAL的异常处理功能的支持，InnoDB存储引擎成为当前MySQL的默认存储引擎。Oracle公司同时也承诺MySQL 5.5和未来版本仍是采用GPL授权的开源产品。
如今MySQL作为当今最流行的开源关系型数据库，在2019年12月最新的db-engines数据库流行度排行中仅次于oracle位居次席，在所有开源数据库产品中排名第一。在市场使用率方面MySQL 以 38.9% 的使用率高居榜首，在全球最大网站Top20中，使用率高达90%。
利用MySQL可以满足绝大多数对数据一致性要求较高的交易型应用场景需求，配合MongoDB和Redis等NoSQL内存数据库和消息队列等工具提供对消息推送、通知等场景支持，可以满足构建各种规模的业务系统的需求。无论是高速发展的互联网公司还是刚刚起步的初创公司，MySQL都将是他们最好的关系型数据库选择之一。
